PHKI - Program Hibah Kompetisi Berbasis Institusi

Permanent URI for this community

https://repository.unri.ac.id/handle/123456789/5752

Browse

Browsing PHKI - Program Hibah Kompetisi Berbasis Institusi by Author "Elvyra, Roza"

Now showing 1 - 2 of 2
  • No Thumbnail Available
    Item
    Eksplorasi Penanda Genetik Spesifik Ikan Endemik Sungai Paparan Banjir Riau (GENUS Kryptopterus DAN Ompok) Berbasis Gen Cox-1 Dan D Loop Region
    (2015-04-11) Elvyra, Roza; Roslim, Dewi Indriyani
    Sungai paparan banjir atau floodplain river di Indonesia hanya ditemukan di Kalimantan, Palembang, Jambi dan Riau. Sungai paparan banjir di Riau umumnya dicirikan oleh warna perairan coklat tua, transparansi tinggi dan pH relatif lebih rendah. Ada beberapa jenis ikan yang bersifat endemik di sungai paparan banjir yaitu jenis-jenis ikan dari genus Kryptopterus dan Ompok yang termasuk famili Siluridae yang dikenal secara umum di Indonesia sebagai ikan lais, dan secara spesifik di Riau dikenal dengan nama ikan selais. Ikan selais merupakan maskot kota Pekanbaru dan ikan konsumsi yang bernilai ekonomis tinggi. Oleh karena potensinya, eksplorasi informasi yang mendalam mengenai ikan ini sangat perlu diketahui dengan pasti terutama dengan teknik molekuler yang telah berkembang pesat akhir-akhir ini. Sampai saat ini, informasi ilmiah mengenai penanda genetik ikan endemik sungai paparan banjir khususnya dari provinsi Riau belum begitu banyak diketahui. Penelitian yang telah dilakukan umumnya masih terbatas secara morfologi. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan penanda genetik spesifik ikan endemik sungai paparan banjir Provinsi Riau, berbasis gen penyandi protein yaitu gen Cox-1 pada tahun pertama, sedangkan pada tahun kedua menentukan penanda genetik spesifik berbasis daerah bukan penyandi protein (non coding region) yaitu D-loop region. Penelitian mengenai penanda genetik spesifik dapat digunakan sebagai DNA barcode yang mencirikan identitas jenis dan asal-usul jenis tersebut. Dalam penelitian tahun kedua, setiap individu dari masing-masing jenis yang didapatkan dari genus Kryptopterus dan Ompok yang menjadi objek penelitian, dilakukan isolasi DNA total dari bagian ototnya. Daerah D-loop region DNA mitokondria dari DNA total akan diamplifikasi dengan primer forward dan reverse menggunakan mesin PCR. Kualitas hasil amplifikasi dapat dilihat pada gel agarose 1,2 % menggunakan mesin elektroforesis. Daerah D-loop region yang teramplifikasi dilakukan perunutan DNAnya dengan mesin perunutan (seqencer) DNA. Hasil runutan yang terdiri dari basa nukleotida DNA mitokondria dianalisis dengan program Mega versi 4,0 untuk mendapatkan data penanda genetik spesifik sebagai DNA barcode masing-masing jenis dan DNA barcode lokasi asalnya berbasis D-loop region.
  • No Thumbnail Available
    Item
    Karakterisasi Morfometrik Dan Meristik Kryptopterus Spp. Di Provinsi Riau
    (2015-07-07) Elvyra, Roza; Yus, Yusnarti
    Ikan Kryptopterus spp. biasa hidup pada ekosistem sungai paparan banjir yang dikenal juga dengan sungai rawa banjiran atau floodplain river. Ikan-ikan dalam genus Kryptopterus di Indonesia dikenal dengan nama ikan lais. Ikan-ikan ini di Indonesia hanya tersebar pada beberapa sungai di Kalimantan dan Sumatera. Salah satu daerah penyebarannya di Sumatera adalah di provinsi Riau. Di provinsi Riau, ikan lais Kryptopterus spp. merupakan ikan yang dikonsumsi masyarakat dan bemilai ekonomis tinggi. Ikan lais dalam bentuk salai (diawetkan dengan cara diasap) merupakan ciri khas makanan daerah Riau. Penelitian yang fokus terhadap jenis-jenis ikan Kryptopterus spp. di Indonesia umumnya dan di Riau khususnya, masih sangat sedikit dilakukan. Informasi yang jelas mengenai keanekaragaman jenis dalam genus Kryptopterus masih perlu digali. Apalagi data keanekaragaman jenis Kryptopterus spp. yang telah dihasilkan dalam buku identifikasi yang ada, sejauh ini masih belum terdokumentasi secara utuh dengan jumlah sampel yang hanya satu-satu. Sementara itu, data mengenai hubungan kekerabatan Kryptopterus spp. balk secara intraspesies maupun interspesies, dan keterkaitan perbedaan morfometrik tubuh Kryptopterus spp. dengan kekhasan parameter fisika kimia habitatnya di sungai-sungai provinsi Riau belum diketahui.